- n -

• N : amber_prmtop_section , fileset , residue , torsion_type
• n : residue , molecule
• N : atype
• n : dockinfo , torsion_type
• N : molecule
• n : gly_keysvals , atype , statsarray , fileslurp , meanvar , linedef
• N : atom , assembly
• n : assignment , tempintset , bondset
• N : ensemble
• n : molbondset , atom
• na : types
• nA : ensemble
• NA : amberaprepinfo
• na : ringmotion , residue_tree_index , residue , molecule , assembly
• nac : rtype
• nai : moiety_selection
• nalt : atom
• NAMDBF : ambermprepinfo
• NAMF : amberrprepinfo
• NAMRES : amberrprepinfo
• naN : moiety_selection
• nan : moiety_selection
• nANG : assembly
• NANT : atype
• nANT : atype , parameter_set
• nAT : parameter_set
• NATCAP : amber_prmtop
• NATEX : amber_prmtop
• NATOM : amber_prmtop
• NATYP : amber_prmtop
• NB : amberaprepinfo
• nb : vibmode , assignment , atommode , atom , assembly , atype
• nb2 : twoassign
• nb2a : twoassign
• nb2s : twoassign
• nbflag : sander_pmemd_ewald
• NBONA : amber_prmtop
• NBONH : amber_prmtop
• nBOX : assembly , ensemble , molecule
• NBPER : amber_prmtop
• nbs : residue
• nBT : atype , parameter_set
• NBT : atype , parameter_set
• nC : boxinfo
• NC : amberaprepinfo
• nc : amber_prmtop_section , ringmotion
• nCD : boxinfo
• nch : atom , atype
• nCLAMBDA : TI_INTEGRATION_INFO
• nclambda : sander_pmemd_cntrl
• ncyc : sander_pmemd_cntrl
• nD : coord_nD , coord_nDi
• nd : atom , residue , molecule
• nDi : nD_index
• nDIH : dockinfo
• nDp : nD_ptrs
• NDPER : amber_prmtop
• nEC : atom_node
• nensi : atom , residue , molecule , assembly , ensemble
• nES : amber_prmtop
• NEXT : amber_prmtop
• nFF : amber_prmtop
• NGPER : amber_prmtop
• nHANT : atype
• nHBT : atype , parameter_set
• NHPARM : amber_prmtop
• nHTRT : atype
• ni : atom_node , atom , residue
• nIOPR : amberrprepinfo
• niso : chirality_description
• nlp : atype
• nm : ensemble_tree_index , assembly , ensemble , types
• nmb : atom
• nmbi : residue_node
• nmbo : residue_node
• nmbs : assembly
• nmi : moiety_selection
• nmn : moiety_selection
• nmN : moiety_selection
• nmropt : sander_pmemd_cntrl
• nMT : parameter_set
• NMXRS : amber_prmtop
• nNANT : atype
• nNBT : parameter_set , atype
• nNTRT : atype
• no : atom_node
• nOD : atom , residue , molecule , assembly , ensemble
• noi : molecule
• nopdA : ringassign
• nopdA1G : ringassign
• nopdOth : ringassign
• nopsA : ringassign
• nopsa : ringassign
• nopss : ringassign
• nopt : sander_pmemd_MD_run_info
• nouttst : sander_pmemd_MD_run_info
• nOV : residue_node , atom_node
• nP : molindex_set
• NPARM : amber_prmtop
• NPHB : amber_prmtop
• NPHIA : amber_prmtop
• NPHIH : amber_prmtop
• npl : amber_prmtop_section
• nPRM : assembly , ensemble
• nps : atom_node
• NPTRA : amber_prmtop
• nr : vibmode , assignment , molecule , assembly , types
• nR : atype
• nr : molecule_tree_index
• nrb : residue
• nrbA : ringassign
• nrba : ringassign
• nrbs : molecule , ringassign
• nrc : residue , molecule
• NRES : amber_prmtop
• nri : moiety_selection
• nring : residue
• nrk : assignment
• nrN : moiety_selection
• nrn : moiety_selection
• nroA : ringassign
• nroa : ringassign
• nros : ringassign
• nrp : residue
• nrpa : ringassign
• nrpA : ringassign
• nrps : ringassign
• nrso : ringassign
• nRT : parameter_set
• ns : vibmode , amber_prmtop_section , assignment
• nS : amber_prmtop
• ns : atommode
• ns2 : twoassign
• ns2a : twoassign
• ns2s : twoassign
• nSC : atype
• nsnb : sander_pmemd_cntrl
• NSP : amber_prmtop
• NSPM : amber_prmtop
• nSPNWT : sander_pmemd_MD_control_info
• NSPSOL : amber_prmtop
• nSS : amber_prmtop
• nstlim : sander_pmemd_cntrl
• NT : bond_type , torsion_type
• nt : assignment , atommode , amber_prmtop_section , vibmode
• NT : atype , angle_type
• nt2 : twoassign
• nt2a : twoassign
• nt2s : twoassign
• ntave : sander_pmemd_cntrl
• ntb : sander_pmemd_cntrl
• ntc : sander_pmemd_cntrl
• ntf : sander_pmemd_cntrl
• NTHETA : amber_prmtop
• NTHETH : amber_prmtop
• ntmin : sander_pmemd_cntrl
• nTOR : assembly
• nTors : dockinfo
• ntp : sander_pmemd_cntrl
• ntpr : sander_pmemd_cntrl
• ntr : sander_pmemd_cntrl
• NTRT : atype
• nTRT : parameter_set , atype
• ntrx : sander_pmemd_cntrl
• ntt : sander_pmemd_cntrl
• ntwe : sander_pmemd_cntrl
• ntwo : assignment
• ntwprt : sander_pmemd_cntrl
• ntwr : sander_pmemd_cntrl
• ntwv : sander_pmemd_cntrl
• ntwx : sander_pmemd_cntrl
• ntx : sander_pmemd_cntrl
• ntxo : sander_pmemd_cntrl
• NTYPES : amber_prmtop
• nu : amber_prmtop_section
• NUMANG : amber_prmtop
• NUMBER : EE_TI_CHANGE_INFO
• NUMBND : amber_prmtop
• numClusters : dockinfo
• NUMEX : amber_prmtop
• nv : vibaddr
• nvec : atom
• nVP : molecule , atype , angle_type , bond_type , types , residue , assembly , torsion_type , atom , ensemble , rtype , mtype
• nw : assignment
• nWIDTHS : TI_INTEGRATION_INFO
• nxva : atom