- p -

• P : molindex_set , torsion_type
• par : ringmotion
• PHASE : amber_prmtop
• PHI : amberaprepinfo
• PK : amber_prmtop
• pm : chirality_description
• PN : amber_prmtop
• POINTERS : amber_prmtop
• POINTSFILE : TI_INTEGRATION_INFO
• posneg : moiety_selection
• pres0 : sander_pmemd_cntrl
• presi : sander_pmemd_cntrl
• PRM : assembly , ensemble
• prmtop : sander_pmemd_command_line
• ps : atom_node
• psi : atom_node
• pvp : ringmotion