- d -

• d : vectormag_3D , position_set , atom
• D : amber_prmtop_section , torsion_index , atom , coord_nD , residue , molecule
• d : residue
• D : coord_nDi , dockinfo , assembly , plane , ensemble
• d : torsion_index , molecule
• D : bond , molbond
• d : statsarray
• D : molbondset , angle_index
• Des : molecule
• desc : amber_prmtop_section
• Desc : ringmotion , vibmode , assignment , assn_brief
• desc : bond_type
• Desc : stretch , torsion
• desc : torsion_type , atype
• Desc : bend
• desc : angle_type
• Di : nD_index , coord_nDi
• dielc : sander_pmemd_cntrl
• DIH : dockinfo
• DL : chirality_description
• DOCK_PROGRAM : dockinfo
• Dp : nD_ptrs
• drms : sander_pmemd_cntrl
• dt : sander_pmemd_cntrl
• dx0 : sander_pmemd_cntrl