• _GNU_SOURCE : mylib.h
• AMBER_PRMTOP_FLAGS : amber_prmtop_structs.h
• AMBER_PRMTOP_FORMATS : amber_prmtop_structs.h
• FALSE : outputPDB.c , writePDB.c
• get_vector : geometry.h
• get_vector_from_coords : geometries.h
• INDEX_INIT : initialize_GLYstruct.c
• LA : load_pdb.h
• PI : geometries.h
• TRUE : outputPDB.c , writePDB.c